Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.8 ms