Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPCDR1Q9BY65 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms