Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP3Q6Q6R5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms