Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CA9Q16790 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CA9Q16790 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CA9Q16790 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CA9Q16790 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CA9Q16790 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CA9Q16790 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CA9Q16790 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CA9Q16790 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CA9Q16790 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CA9Q16790 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CA9Q16790 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CA9Q16790 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CA9Q16790 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CA9Q16790 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CA9Q16790 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CA9Q16790 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CA9Q16790 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CA9Q16790 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CA9Q16790 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CA9Q16790 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CA9Q16790 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CA9Q16790 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CA9Q16790 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CA9Q16790 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CA9Q16790 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CA9Q16790 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CA9Q16790 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CA9Q16790 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CA9Q16790 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CA9Q16790 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CA9Q16790 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CA9Q16790 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CA9Q16790 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CA9Q16790 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CA9Q16790 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CA9Q16790 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CA9Q16790 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CA9Q16790 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CA9Q16790 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA9Q16790 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CA9Q16790 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CA9Q16790 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CA9Q16790 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA9Q16790 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CA9Q16790 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CA9Q16790 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CA9Q16790 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CA9Q16790 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CA9Q16790 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CA9Q16790 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CA9Q16790 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CA9Q16790 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CA9Q16790 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CA9Q16790 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CA9Q16790 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CA9Q16790 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CA9Q16790 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CA9Q16790 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CA9Q16790 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CA9Q16790 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CA9Q16790 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CA9Q16790 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CA9Q16790 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CA9Q16790 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CA9Q16790 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CA9Q16790 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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