Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms