Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
GRIN2AQ12879 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms