Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC63Q05C16 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms