Protein–RNA interactions for Protein: P41212

ETV6, Transcription factor ETV6, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV6P41212 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV6P41212 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV6P41212 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV6P41212 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV6P41212 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV6P41212 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV6P41212 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV6P41212 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV6P41212 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV6P41212 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ETV6P41212 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ETV6P41212 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV6P41212 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV6P41212 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV6P41212 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV6P41212 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV6P41212 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV6P41212 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV6P41212 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV6P41212 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV6P41212 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV6P41212 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV6P41212 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV6P41212 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV6P41212 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV6P41212 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV6P41212 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV6P41212 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV6P41212 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV6P41212 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV6P41212 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV6P41212 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV6P41212 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV6P41212 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV6P41212 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV6P41212 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms