Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms