Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TNIKQ9UKE5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TNIKQ9UKE5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNIKQ9UKE5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNIKQ9UKE5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNIKQ9UKE5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNIKQ9UKE5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
TNIKQ9UKE5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNIKQ9UKE5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNIKQ9UKE5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms