Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NECAP2Q9NVZ3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NECAP2Q9NVZ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms