Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PNPLA3Q9NST1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNPLA3Q9NST1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms