Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms