Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP13Q86W25 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms