Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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