Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MUSKO15146 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MUSKO15146 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MUSKO15146 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MUSKO15146 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MUSKO15146 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MUSKO15146 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MUSKO15146 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MUSKO15146 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MUSKO15146 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MUSKO15146 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MUSKO15146 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MUSKO15146 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MUSKO15146 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUSKO15146 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUSKO15146 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUSKO15146 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MUSKO15146 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MUSKO15146 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MUSKO15146 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MUSKO15146 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MUSKO15146 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MUSKO15146 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MUSKO15146 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MUSKO15146 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MUSKO15146 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MUSKO15146 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUSKO15146 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUSKO15146 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUSKO15146 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUSKO15146 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MUSKO15146 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUSKO15146 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUSKO15146 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUSKO15146 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUSKO15146 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUSKO15146 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MUSKO15146 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUSKO15146 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms