Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIPT2A6NK58 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms