Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms