Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR53Q7Z5U6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms