Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIF1AQ16665 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIF1AQ16665 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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