Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NID2Q14112 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NID2Q14112 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NID2Q14112 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NID2Q14112 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NID2Q14112 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NID2Q14112 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NID2Q14112 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NID2Q14112 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NID2Q14112 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NID2Q14112 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NID2Q14112 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NID2Q14112 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NID2Q14112 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NID2Q14112 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NID2Q14112 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NID2Q14112 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NID2Q14112 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NID2Q14112 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID2Q14112 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID2Q14112 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NID2Q14112 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NID2Q14112 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NID2Q14112 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NID2Q14112 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NID2Q14112 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NID2Q14112 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NID2Q14112 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NID2Q14112 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NID2Q14112 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NID2Q14112 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NID2Q14112 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NID2Q14112 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NID2Q14112 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NID2Q14112 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NID2Q14112 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NID2Q14112 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NID2Q14112 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NID2Q14112 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NID2Q14112 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NID2Q14112 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NID2Q14112 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NID2Q14112 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NID2Q14112 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NID2Q14112 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NID2Q14112 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NID2Q14112 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NID2Q14112 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NID2Q14112 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NID2Q14112 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NID2Q14112 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms