Protein–RNA interactions for Protein: Q07478

SUB2, ATP-dependent RNA helicase SUB2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUB2Q07478 BRR6YGL247W 594 nt5.49□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 SOP4YJL192C 705 nt5.49□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 APS1YLR170C 471 nt5.49□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 SWS2YNL081C 432 nt5.49□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 NTA1YJR062C 1374 nt5.49□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 HRR25YPL204W 1485 nt5.49□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 STP1YDR463W 1560 nt5.49□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 ERG11YHR007C 1593 nt5.49□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 PHO84YML123C 1764 nt5.48□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 PHR1YOR386W 1698 nt5.48□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 SPO73YER046W 432 nt5.48□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 SDL1YIL167W 633 nt5.48□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YLL044WYLL044W 447 nt5.48□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt5.48□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 MNT4YNR059W 1743 nt5.48□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 EPS1YIL005W 2106 nt5.47□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 RSC3YDR303C 2658 nt5.47□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 AGA2YGL032C 264 nt5.47□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 SNX4YJL036W 1272 nt5.47□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 VPS63YLR261C 327 nt5.47□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YOR082CYOR082C 342 nt5.47□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YOL153CYOL153C 1746 nt5.47□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 CIT1YNR001C 1440 nt5.47□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 VHR1YIL056W 1923 nt5.46□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 XKS1YGR194C 1803 nt5.46□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 FAA3YIL009W 2085 nt5.46□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 DAP2YHR028C 2457 nt5.46□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YHL049CYHL049C 816 nt5.46□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YKL223WYKL223W 333 nt5.46□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 IMP1YMR150C 573 nt5.46□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YNL057WYNL057W 333 nt5.46□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt5.46□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 CMD1YBR109C 444 nt5.46□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 RPB5YBR154C 648 nt5.46□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 SUC2YIL162W 1599 nt5.46□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 PRR1YKL116C 1557 nt5.46□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 UBP12YJL197W 3765 nt5.45□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 SYO1YDL063C 1863 nt5.45□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 SIN4YNL236W 2925 nt5.45□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 NCB2YDR397C 441 nt5.45□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YJR037WYJR037W 384 nt5.45□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YLR171WYLR171W 390 nt5.45□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 SIL1YOL031C 1266 nt5.45□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 REI1YBR267W 1182 nt5.45□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 UTP25YIL091C 2166 nt5.45□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 STE24YJR117W 1362 nt5.44□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 NTF2YER009W 378 nt5.44□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 PUG1YER185W 912 nt5.44□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YIR014WYIR014W 729 nt5.44□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 CDC21YOR074C 915 nt5.44□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YPL088WYPL088W 1029 nt5.44□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 NDC80YIL144W 2076 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 PDR15YDR406W 4590 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 SEC2YNL272C 2280 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 SLD5YDR489W 885 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 TDA2YER071C 381 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 RTR1YER139C 681 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 THI5YFL058W 1023 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 COX2Q0250 756 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YJL193WYJL193W 1209 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 VPS51YKR020W 495 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 NMA1YLR328W 1206 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YNL150WYNL150W 408 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 THI12YNL332W 1023 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 PHO88YBR106W 567 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 SEC66YBR171W 621 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 LST4YKL176C 2487 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 ARP4YJL081C 1470 nt5.43□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 MDM34YGL219C 1380 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 ALO1YML086C 1581 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 APC4YDR118W 1959 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 MRF1YGL143C 1242 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 RPL9AYGL147C 576 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YGR018CYGR018C 330 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YJL119CYJL119C 324 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YKL069WYKL069W 543 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YLR297WYLR297W 390 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YNR021WYNR021W 1215 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YCL022CYCL022C 516 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 SWI3YJL176C 2478 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 HPF1YOL155C 2904 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 GSY2YLR258W 2118 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YNL095CYNL095C 1929 nt5.42□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 PDR10YOR328W 4695 nt5.41□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YOL019WYOL019W 1656 nt5.41□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 THI20YOL055C 1656 nt5.41□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 RUD3YOR216C 1455 nt5.41□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 RRP42YDL111C 798 nt5.41□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 SPR6YER115C 576 nt5.41□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 MRP49YKL167C 414 nt5.41□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 RPL18BYNL301C 561 nt5.41□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 ISU2YOR226C 471 nt5.41□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 YPR136CYPR136C 513 nt5.41□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 UBP6YFR010W 1500 nt5.41□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.41□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 RAT1YOR048C 3021 nt5.4□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 FAD1YDL045C 921 nt5.4□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 HLR1YDR528W 1272 nt5.4□□□□□ -1.54
SUB2Q07478 SAE2YGL175C 1038 nt5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44 ms