RNA–Protein interactions for RNA: YHL049C

YHL049C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YHL049C, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL049CYHL049C MTC1P47018 478 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
YHL049CYHL049C DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
YHL049CYHL049C FAP1P53971 965 aa10.4□□□□□ -0.74
YHL049CYHL049C PRY3P47033 881 aa9.82□□□□□ -0.84
YHL049CYHL049C PRI1P10363 409 aa9.73□□□□□ -0.85
YHL049CYHL049C AAD16Q02895 342 aa9.66□□□□□ -0.86
YHL049CYHL049C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
YHL049CYHL049C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
YHL049CYHL049C ISW2Q08773 1120 aa9.43□□□□□ -0.9
YHL049CYHL049C YCK3P39962 524 aa9.39□□□□□ -0.91
YHL049CYHL049C RPG1P38249 964 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
YHL049CYHL049C AVT3P36062 692 aa9.33□□□□□ -0.92
YHL049CYHL049C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
YHL049CYHL049C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
YHL049CYHL049C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
YHL049CYHL049C MRPL32P25348 183 aa8.77□□□□□ -1.01
YHL049CYHL049C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
YHL049CYHL049C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
YHL049CYHL049C TFA1P36100 482 aa8.69□□□□□ -1.02
YHL049CYHL049C REB1P21538 810 aa8.65□□□□□ -1.02
YHL049CYHL049C YGL015CP33199 130 aa8.47□□□□□ -1.05
YHL049CYHL049C SPT21P35209 758 aa8.42□□□□□ -1.06
YHL049CYHL049C CDC27P38042 758 aa8.36□□□□□ -1.07
YHL049CYHL049C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YHL049CYHL049C RIM101P33400 625 aa8.24□□□□□ -1.09
YHL049CYHL049C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
YHL049CYHL049C MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
YHL049CYHL049C TFC8Q12308 588 aa8.1□□□□□ -1.11
YHL049CYHL049C HOP09932 586 aa8.08□□□□□ -1.12
YHL049CYHL049C DCD1P06773 312 aa8.06□□□□□ -1.12
YHL049CYHL049C OXP1P28273 1286 aa7.96□□□□□ -1.14
YHL049CYHL049C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
YHL049CYHL049C SCY1P53009 804 aa7.89□□□□□ -1.15
YHL049CYHL049C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
YHL049CYHL049C BCH2P36122 765 aa7.82□□□□□ -1.16
YHL049CYHL049C PTP3P40048 928 aa7.81□□□□□ -1.16
YHL049CYHL049C SLX5P32828 619 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
YHL049CYHL049C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
YHL049CYHL049C TGL3P40308 642 aa7.75□□□□□ -1.17
YHL049CYHL049C SSP1P38871 571 aa7.74□□□□□ -1.17
YHL049CYHL049C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
YHL049CYHL049C RSM7P47150 247 aa7.73□□□□□ -1.17
YHL049CYHL049C YLR271WQ06152 274 aa7.69□□□□□ -1.18
YHL049CYHL049C EPS1P40557 701 aa7.63□□□□□ -1.19
YHL049CYHL049C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.63□□□□□ -1.19not detected
YHL049CYHL049C AI2P03876 854 aa7.62□□□□□ -1.19
YHL049CYHL049C BDF1P35817 686 aa7.59□□□□□ -1.19
YHL049CYHL049C BBC1P47068 1157 aa7.59□□□□□ -1.19
YHL049CYHL049C UBP9P39967 754 aa7.53□□□□□ -1.2
YHL049CYHL049C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YHL049CYHL049C MGA2P40578 1113 aa7.48□□□□□ -1.21
YHL049CYHL049C SIS1P25294 352 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
YHL049CYHL049C MST1P07236 462 aa7.44□□□□□ -1.22
YHL049CYHL049C CST9Q06032 482 aa7.44□□□□□ -1.22
YHL049CYHL049C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data7.38□□□□□ -1.23not detected
YHL049CYHL049C MRM1P25270 412 aa7.37□□□□□ -1.23
YHL049CYHL049C YOR238WQ08634 303 aa7.35□□□□□ -1.23
YHL049CYHL049C YBL029C-AQ3E756 94 aa7.32□□□□□ -1.24
YHL049CYHL049C YAP5P40574 245 aa7.28□□□□□ -1.24
YHL049CYHL049C RTG3P38165 486 aa7.25□□□□□ -1.25
YHL049CYHL049C VNX1P42839 908 aa7.24□□□□□ -1.25
YHL049CYHL049C RCR1P38212 213 aa7.21□□□□□ -1.26
YHL049CYHL049C VPS29P38759 282 aa7.21□□□□□ -1.26
YHL049CYHL049C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.16□□□□□ -1.26not detected
YHL049CYHL049C WSC3Q12215 556 aa7.16□□□□□ -1.26
YHL049CYHL049C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
YHL049CYHL049C RAM2P29703 316 aa7.15□□□□□ -1.26
YHL049CYHL049C SPP1Q03012 353 aa7.15□□□□□ -1.26
YHL049CYHL049C DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
YHL049CYHL049C STS1P38637 319 aa7.1□□□□□ -1.27
YHL049CYHL049C PIB1Q06651 286 aa7.1□□□□□ -1.27
YHL049CYHL049C TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
YHL049CYHL049C YFR006WP43590 535 aa7.09□□□□□ -1.27
YHL049CYHL049C GTT3P39996 337 aa7.08□□□□□ -1.28
YHL049CYHL049C MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YHL049CYHL049C FKH1P40466 484 aa7.05□□□□□ -1.28
YHL049CYHL049C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YHL049CYHL049C DMA1P38823 416 aa7.03□□□□□ -1.28
YHL049CYHL049C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YHL049CYHL049C IOC2Q12072 812 aa7□□□□□ -1.29
YHL049CYHL049C ULI1P43604 169 aa6.98□□□□□ -1.29
YHL049CYHL049C LDB19Q12502 818 aa6.97□□□□□ -1.29
YHL049CYHL049C COQ8P27697 501 aa6.96□□□□□ -1.3
YHL049CYHL049C MIF2P35201 549 aa6.95□□□□□ -1.3
YHL049CYHL049C SAM3Q08986 587 aa6.95□□□□□ -1.3
YHL049CYHL049C MSB4Q12317 492 aa6.95□□□□□ -1.3
YHL049CYHL049C YOL036WQ08206 761 aa6.94□□□□□ -1.3
YHL049CYHL049C EDS1P38073 919 aa6.93□□□□□ -1.3
YHL049CYHL049C SET1P38827 1080 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
YHL049CYHL049C YJL171CP46992 396 aa6.9□□□□□ -1.3
YHL049CYHL049C PTC3P34221 468 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
YHL049CYHL049C EAP1P36041 632 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
YHL049CYHL049C SET4P42948 560 aa6.89□□□□□ -1.31
YHL049CYHL049C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
YHL049CYHL049C TRP5P00931 707 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
YHL049CYHL049C GYP5Q12344 894 aa6.87□□□□□ -1.31
YHL049CYHL049C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
YHL049CYHL049C ABP1P15891 592 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
YHL049CYHL049C RTG1P32607 177 aa6.84□□□□□ -1.31
YHL049CYHL049C BMT6Q12291 365 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.3 ms