Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBSP08397 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBSP08397 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBSP08397 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBSP08397 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBSP08397 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBSP08397 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBSP08397 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBSP08397 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBSP08397 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBSP08397 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBSP08397 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBSP08397 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBSP08397 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBSP08397 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBSP08397 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBSP08397 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBSP08397 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBSP08397 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBSP08397 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBSP08397 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBSP08397 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBSP08397 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBSP08397 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBSP08397 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBSP08397 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBSP08397 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBSP08397 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBSP08397 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBSP08397 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBSP08397 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBSP08397 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBSP08397 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBSP08397 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBSP08397 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBSP08397 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBSP08397 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBSP08397 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBSP08397 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMBSP08397 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMBSP08397 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMBSP08397 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms