Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TK1P04183 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TK1P04183 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TK1P04183 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TK1P04183 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TK1P04183 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TK1P04183 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TK1P04183 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TK1P04183 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TK1P04183 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TK1P04183 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TK1P04183 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TK1P04183 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TK1P04183 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TK1P04183 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TK1P04183 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TK1P04183 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TK1P04183 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TK1P04183 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TK1P04183 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TK1P04183 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TK1P04183 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TK1P04183 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TK1P04183 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TK1P04183 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TK1P04183 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TK1P04183 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TK1P04183 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TK1P04183 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms