Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFFAO00273 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFFAO00273 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFFAO00273 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DFFAO00273 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFFAO00273 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFFAO00273 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DFFAO00273 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFFAO00273 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DFFAO00273 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFFAO00273 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFFAO00273 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFFAO00273 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DFFAO00273 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFFAO00273 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFFAO00273 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFFAO00273 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFFAO00273 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFFAO00273 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFFAO00273 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFFAO00273 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFFAO00273 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFFAO00273 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFFAO00273 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFFAO00273 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFFAO00273 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFFAO00273 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFFAO00273 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFFAO00273 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFFAO00273 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFFAO00273 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFFAO00273 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFFAO00273 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFFAO00273 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DFFAO00273 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DFFAO00273 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DFFAO00273 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DFFAO00273 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DFFAO00273 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DFFAO00273 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DFFAO00273 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DFFAO00273 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DFFAO00273 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DFFAO00273 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DFFAO00273 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DFFAO00273 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DFFAO00273 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DFFAO00273 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DFFAO00273 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms