Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms