Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXW11Q9UKB1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.5 ms