Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN1P53805 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN1P53805 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms