Protein–RNA interactions for Protein: P49116

NR2C2, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C2P49116 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR2C2P49116 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR2C2P49116 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms