Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C6orf47O95873 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms