Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A3Q16572 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms