Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 YGR237CYGR237C 2358 nt3.02□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 MCM21YDR318W 1107 nt3.02□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 COQ9YLR201C 783 nt3.02□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 TAF4YMR005W 1167 nt3.02□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.02□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YBL081WYBL081W 1107 nt3.02□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 RAS1YOR101W 930 nt3.02□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 TDA1YMR291W 1761 nt3.02□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 FRE4YNR060W 2160 nt3.01□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 PST1YDR055W 1335 nt3.01□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YDL162CYDL162C 357 nt3.01□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 RPS23AYGR118W 438 nt3.01□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YVH1YIR026C 1095 nt3.01□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 RPA43YOR340C 981 nt3.01□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 RPS23BYPR132W 438 nt3.01□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YBR089WYBR089W 600 nt3.01□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 STT4YLR305C 5703 nt3.01□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 DBP5YOR046C 1449 nt3.01□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 CDC40YDR364C 1368 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YSP2YDR326C 4317 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 TGL2YDR058C 981 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 USE1YGL098W 738 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YGL214WYGL214W 486 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 AML1YGR001C 747 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 DLS1YJL065C 504 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YLR416CYLR416C 399 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 HUB1YNR032C-A 222 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 FUN30YAL019W 3396 nt3□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 snR63snR63 255 nt2.99□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YDR340WYDR340W 303 nt2.99□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 PAN5YHR063C 1140 nt2.99□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 AGE2YIL044C 897 nt2.99□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 PNT1YOR266W 1272 nt2.99□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 HUT1YPL244C 1020 nt2.99□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 EBS1YDR206W 2655 nt2.99□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 STE6YKL209C 3873 nt2.99□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 MET10YFR030W 3108 nt2.99□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YTA7YGR270W 4140 nt2.99□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 LCB4YOR171C 1875 nt2.99□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 VPS17YOR132W 1656 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 BCH1YMR237W 2175 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 KTR6YPL053C 1341 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 MIP6YHR015W 1980 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 ACA1YER045C 1470 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 NSE3YDR288W 912 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YGL082WYGL082W 1146 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YIL175WYIL175W 318 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 RPS21BYJL136C 264 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 RPC37YKR025W 849 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 GMH1YKR030W 822 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YLR444CYLR444C 303 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 TIF34YMR146C 1044 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YBL065WYBL065W 345 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 OXR1YPL196W 822 nt2.98□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YDL180WYDL180W 1644 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 STP2YHR006W 1626 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 PHO81YGR233C 3537 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 EMP70YLR083C 2004 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 CDH1YGL003C 1701 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 MSM1YGR171C 1728 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 DTD1YDL219W 453 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YDR355CYDR355C 303 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 SPT2YER161C 1002 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 SCL1YGL011C 759 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 MSA2YKR077W 1092 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 HRT3YLR097C 1035 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 HHF1YBR009C 312 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 CAF20YOR276W 486 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 HRD1YOL013C 1656 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 NDC80YIL144W 2076 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 TRM12YML005W 1389 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 SPO14YKR031C 5052 nt2.96□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 CHS2YBR038W 2892 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 RPL1BYGL135W 654 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 EDC1YGL222C 528 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 CIR1YGR207C 786 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 YPT35YHR105W 645 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 IME1YJR094C 1083 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 REX3YLR107W 1215 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 MRPS17YMR188C 714 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 PFK27YOL136C 1194 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 RPL1AYPL220W 654 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 ARO1YDR127W 4767 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 JJJ1YNL227C 1773 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 YOR365CYOR365C 2112 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 VBA4YDR119W 2307 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 CDC26YFR036W 375 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 MRPS35YGR165W 1038 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 YMR141CYMR141C 309 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 YMR310CYMR310C 954 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 YBR053CYBR053C 1077 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF8Q12483 snR42snR42 351 nt2.95□□□□□ -1.94
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