RNA–Protein interactions for RNA: YOR266W

PNT1, Transcript of Mitochondrial integral inner membrane protein, yeast

Gene PNT1, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PNT1	YOR266W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	14.27	□□□□□ -0.13
PNT1	YOR266W	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PNT1	YOR266W	FAP1	P53971	965 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PNT1	YOR266W	PRY3	P47033	881 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PNT1	YOR266W	PRI1	P10363	409 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNT1	YOR266W	AAD16	Q02895	342 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNT1	YOR266W	ISW2	Q08773	1120 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PNT1	YOR266W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PNT1	YOR266W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PNT1	YOR266W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
PNT1	YOR266W	YCK3	P39962	524 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PNT1	YOR266W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PNT1	YOR266W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PNT1	YOR266W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PNT1	YOR266W	MRPL32	P25348	183 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PNT1	YOR266W	AVT3	P36062	692 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PNT1	YOR266W	REB1	P21538	810 aa		10.92	□□□□□ -0.66
PNT1	YOR266W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
PNT1	YOR266W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
PNT1	YOR266W	YGL015C	P33199	130 aa		10.72	□□□□□ -0.69
PNT1	YOR266W	TFA1	P36100	482 aa		10.72	□□□□□ -0.69
PNT1	YOR266W	SPT21	P35209	758 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PNT1	YOR266W	CDC27	P38042	758 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PNT1	YOR266W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PNT1	YOR266W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PNT1	YOR266W	TFC8	Q12308	588 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PNT1	YOR266W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PNT1	YOR266W	HO	P09932	586 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PNT1	YOR266W	RIM101	P33400	625 aa		10	□□□□□ -0.81
PNT1	YOR266W	DCD1	P06773	312 aa		9.91	□□□□□ -0.82
PNT1	YOR266W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	9.91	□□□□□ -0.82
PNT1	YOR266W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	9.87	□□□□□ -0.83
PNT1	YOR266W	SCY1	P53009	804 aa		9.85	□□□□□ -0.83
PNT1	YOR266W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
PNT1	YOR266W	TGL3	P40308	642 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PNT1	YOR266W	BCH2	P36122	765 aa		9.74	□□□□□ -0.85
PNT1	YOR266W	UBP9	P39967	754 aa		9.65	□□□□□ -0.86
PNT1	YOR266W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
PNT1	YOR266W	OXP1	P28273	1286 aa		9.56	□□□□□ -0.88
PNT1	YOR266W	PTP3	P40048	928 aa		9.55	□□□□□ -0.88
PNT1	YOR266W	EPS1	P40557	701 aa		9.51	□□□□□ -0.89
PNT1	YOR266W	BDF1	P35817	686 aa		9.47	□□□□□ -0.89
PNT1	YOR266W	BBC1	P47068	1157 aa		9.46	□□□□□ -0.9
PNT1	YOR266W	RSM7	P47150	247 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PNT1	YOR266W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	9.4	□□□□□ -0.9	not detected
PNT1	YOR266W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PNT1	YOR266W	MST1	P07236	462 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNT1	YOR266W	YOR238W	Q08634	303 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PNT1	YOR266W	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
PNT1	YOR266W	AI2	P03876	854 aa		9.31	□□□□□ -0.92
PNT1	YOR266W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
PNT1	YOR266W	YAP5	P40574	245 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PNT1	YOR266W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	9.14	□□□□□ -0.95	not detected
PNT1	YOR266W	YLR271W	Q06152	274 aa		9.13	□□□□□ -0.95
PNT1	YOR266W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PNT1	YOR266W	VNX1	P42839	908 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNT1	YOR266W	GTT3	P39996	337 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNT1	YOR266W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PNT1	YOR266W	SSP1	P38871	571 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PNT1	YOR266W	SPP1	Q03012	353 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PNT1	YOR266W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	8.96	□□□□□ -0.98
PNT1	YOR266W	WSC3	Q12215	556 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PNT1	YOR266W	MRM1	P25270	412 aa		8.93	□□□□□ -0.98
PNT1	YOR266W	MGA2	P40578	1113 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNT1	YOR266W	MSB4	Q12317	492 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNT1	YOR266W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	8.88	□□□□□ -0.99
PNT1	YOR266W	DMA1	P38823	416 aa		8.86	□□□□□ -0.99
PNT1	YOR266W	YJL171C	P46992	396 aa		8.86	□□□□□ -0.99
PNT1	YOR266W	FKH1	P40466	484 aa		8.85	□□□□□ -0.99
PNT1	YOR266W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	8.85	□□□□□ -0.99	not detected
PNT1	YOR266W	RTG3	P38165	486 aa		8.83	□□□□□ -1
PNT1	YOR266W	ULI1	P43604	169 aa		8.81	□□□□□ -1
PNT1	YOR266W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	8.8	□□□□□ -1
PNT1	YOR266W	PIB1	Q06651	286 aa		8.78	□□□□□ -1
PNT1	YOR266W	LDB19	Q12502	818 aa		8.78	□□□□□ -1
PNT1	YOR266W	CST9	Q06032	482 aa		8.75	□□□□□ -1.01
PNT1	YOR266W	IOC2	Q12072	812 aa		8.75	□□□□□ -1.01
PNT1	YOR266W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	8.74	□□□□□ -1.01
PNT1	YOR266W	VPS29	P38759	282 aa		8.73	□□□□□ -1.01
PNT1	YOR266W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	8.72	□□□□□ -1.01
PNT1	YOR266W	YOL036W	Q08206	761 aa		8.72	□□□□□ -1.01
PNT1	YOR266W	BMT6	Q12291	365 aa		8.71	□□□□□ -1.02
PNT1	YOR266W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	8.69	□□□□□ -1.02
PNT1	YOR266W	SAM3	Q08986	587 aa		8.69	□□□□□ -1.02
PNT1	YOR266W	SET4	P42948	560 aa		8.67	□□□□□ -1.02
PNT1	YOR266W	SEC61	P32915	480 aa		8.65	□□□□□ -1.02
PNT1	YOR266W	STS1	P38637	319 aa		8.64	□□□□□ -1.03
PNT1	YOR266W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	8.64	□□□□□ -1.03
PNT1	YOR266W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	8.63	□□□□□ -1.03
PNT1	YOR266W	RTG1	P32607	177 aa		8.63	□□□□□ -1.03
PNT1	YOR266W	YFR006W	P43590	535 aa		8.62	□□□□□ -1.03
PNT1	YOR266W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	8.61	□□□□□ -1.03
PNT1	YOR266W	NCR1	Q12200	1170 aa		8.61	□□□□□ -1.03
PNT1	YOR266W	JIP4	Q03361	876 aa		8.59	□□□□□ -1.03
PNT1	YOR266W	GYP5	Q12344	894 aa		8.55	□□□□□ -1.04
PNT1	YOR266W	RCR1	P38212	213 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PNT1	YOR266W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	8.52	□□□□□ -1.05
PNT1	YOR266W	HTA2	P04912	132 aa		8.52	□□□□□ -1.05
PNT1	YOR266W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	8.45	□□□□□ -1.06
PNT1	YOR266W	PTC4	P38089	393 aa		8.45	□□□□□ -1.06

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