Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POU5F1Q01860 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POU5F1Q01860 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms