Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	RUF5-1	RUF5-1	710 nt		3.12	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	RUF5-2	RUF5-2	710 nt		3.12	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	FLO10	YKR102W	3510 nt		3.12	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	UTP6	YDR449C	1323 nt		3.12	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	BAR1	YIL015W	1764 nt		3.12	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	DHR2	YKL078W	2208 nt		3.12	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	TMA108	YIL137C	2841 nt		3.11	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YHP1	YDR451C	1062 nt		3.11	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YGL118C	YGL118C	438 nt		3.11	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	ARO4	YBR249C	1113 nt		3.11	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	SDS23	YGL056C	1584 nt		3.11	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	STT4	YLR305C	5703 nt		3.11	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	snR63	snR63	255 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	DET1	YDR051C	1005 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	ECO1	YFR027W	846 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	EDC1	YGL222C	528 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	HRT3	YLR097C	1035 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	USB1	YLR132C	873 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	TEM1	YML064C	738 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	COX14	YML129C	213 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	RIM9	YMR063W	720 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YBL094C	YBL094C	333 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	SIL1	YOL031C	1266 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	RFM1	YOR279C	933 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	FES1	YBR101C	873 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YME2	YMR302C	2553 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	SYT1	YPR095C	3681 nt		3.1	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YFL051C	YFL051C	483 nt		3.09	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	PET130	YJL023C	1044 nt		3.09	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YKL222C	YKL222C	2118 nt		3.09	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YLR363W-A	YLR363W-A	258 nt		3.09	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	PNT1	YOR266W	1272 nt		3.09	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YBR096W	YBR096W	693 nt		3.09	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	HEF3	YNL014W	3135 nt		3.08	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	EPL1	YFL024C	2499 nt		3.08	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	GRX3	YDR098C	858 nt		3.08	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	PDX1	YGR193C	1233 nt		3.08	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YIR014W	YIR014W	729 nt		3.08	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	REH1	YLR387C	1299 nt		3.08	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YNL013C	YNL013C	378 nt		3.08	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	HSH49	YOR319W	642 nt		3.08	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	RPS11B	YBR048W	471 nt		3.08	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	OXR1	YPL196W	822 nt		3.08	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	RIB5	YBR256C	717 nt		3.08	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	MDM1	YML104C	3384 nt		3.08	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YJR030C	YJR030C	2238 nt		3.08	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	VPS17	YOR132W	1656 nt		3.08	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YKR015C	YKR015C	1707 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	JJJ1	YNL227C	1773 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	DSS1	YMR287C	2910 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	NMD2	YHR077C	3270 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	CPA2	YJR109C	3357 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	PDS1	YDR113C	1122 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	OKP1	YGR179C	1221 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	IRC18	YJL037W	675 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YKL033W-A	YKL033W-A	711 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	MRPS17	YMR188C	714 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	POS5	YPL188W	1245 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	USV1	YPL230W	1176 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	PST1	YDR055W	1335 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	TRM12	YML005W	1389 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	MIC60	YKR016W	1623 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	CTM1	YHR109W	1758 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	HDA2	YDR295C	2025 nt		3.07	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	RSE1	YML049C	4086 nt		3.06	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	FAA2	YER015W	2235 nt		3.06	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YOS1	YER074W-A	258 nt		3.06	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YPT35	YHR105W	645 nt		3.06	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	RPC37	YKR025W	849 nt		3.06	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	ERP1	YAR002C-A	660 nt		3.06	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	NIT3	YLR351C	876 nt		3.06	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	SEC59	YMR013C	1560 nt		3.06	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YMR087W	YMR087W	855 nt		3.06	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	IAH1	YOR126C	717 nt		3.06	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	KTR6	YPL053C	1341 nt		3.06	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	PHO5	YBR093C	1404 nt		3.06	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	ZDS2	YML109W	2829 nt		3.06	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	PWP2	YCR057C	2772 nt		3.06	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	SPO14	YKR031C	5052 nt		3.05	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YLR177W	YLR177W	1887 nt		3.05	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	NEM1	YHR004C	1341 nt		3.05	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YGL218W	YGL218W	651 nt		3.05	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YIL025C	YIL025C	375 nt		3.05	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YAL069W	YAL069W	315 nt		3.05	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	REX3	YLR107W	1215 nt		3.05	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	BLS1	YLR408C	369 nt		3.05	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	RRG9	YNL213C	645 nt		3.05	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	FLO1	YAR050W	4614 nt		3.05	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	REB1	YBR049C	2433 nt		3.04	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	VPS33	YLR396C	2076 nt		3.04	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	GYP6	YJL044C	1377 nt		3.04	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	TLC1	TLC1	1301 nt		3.04	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	HMF1	YER057C	390 nt		3.04	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	CFD1	YIL003W	882 nt		3.04	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	MED11	YMR112C	396 nt		3.04	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YSP2	YDR326C	4317 nt		3.04	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	ECM21	YBL101C	3354 nt		3.04	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	PCL2	YDL127W	927 nt		3.03	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YDR290W	YDR290W	330 nt		3.03	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	RPL23B	YER117W	414 nt		3.03	□□□□□ -1.92

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