Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RXRAP19793 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RXRAP19793 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RXRAP19793 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RXRAP19793 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RXRAP19793 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RXRAP19793 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RXRAP19793 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RXRAP19793 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RXRAP19793 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RXRAP19793 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RXRAP19793 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRAP19793 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRAP19793 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRAP19793 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRAP19793 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRAP19793 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRAP19793 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRAP19793 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRAP19793 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRAP19793 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRAP19793 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRAP19793 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRAP19793 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRAP19793 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRAP19793 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRAP19793 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRAP19793 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRAP19793 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRAP19793 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRAP19793 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRAP19793 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRAP19793 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRAP19793 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRAP19793 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRAP19793 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRAP19793 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRAP19793 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRAP19793 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRAP19793 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRAP19793 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRAP19793 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRAP19793 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRAP19793 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRAP19793 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRAP19793 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRAP19793 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRAP19793 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRAP19793 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRAP19793 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRAP19793 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RXRAP19793 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RXRAP19793 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RXRAP19793 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RXRAP19793 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RXRAP19793 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RXRAP19793 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RXRAP19793 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RXRAP19793 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RXRAP19793 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RXRAP19793 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RXRAP19793 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RXRAP19793 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RXRAP19793 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RXRAP19793 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RXRAP19793 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RXRAP19793 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RXRAP19793 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RXRAP19793 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RXRAP19793 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RXRAP19793 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RXRAP19793 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RXRAP19793 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RXRAP19793 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RXRAP19793 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RXRAP19793 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RXRAP19793 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RXRAP19793 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RXRAP19793 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RXRAP19793 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RXRAP19793 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RXRAP19793 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RXRAP19793 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RXRAP19793 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RXRAP19793 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RXRAP19793 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RXRAP19793 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RXRAP19793 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RXRAP19793 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RXRAP19793 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RXRAP19793 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RXRAP19793 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RXRAP19793 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RXRAP19793 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RXRAP19793 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RXRAP19793 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RXRAP19793 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RXRAP19793 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RXRAP19793 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RXRAP19793 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms