Protein–RNA interactions for Protein: A5YM72

CARNS1, Carnosine synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARNS1A5YM72 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARNS1A5YM72 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARNS1A5YM72 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms