Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC78A2IDD5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms