Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms