Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTD1Q8N815 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms