Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY4

ZCCHC8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC8Q6NZY4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC8Q6NZY4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC8Q6NZY4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms