Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8Q15843 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8Q15843 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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