Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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