Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKN1CP49918 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN1CP49918 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms