Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SARS2Q9NP81 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SARS2Q9NP81 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms