Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VPS25Q9BRG1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS25Q9BRG1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms