RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.67■■■□□ 2.34
PACS1-201ENST00000320580 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
PACS1-201ENST00000320580 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
PACS1-201ENST00000320580 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.19■■□□□ 1.94
PACS1-201ENST00000320580 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.15■■□□□ 1.94
PACS1-201ENST00000320580 HRCP23327 699 aa27.03■■□□□ 1.92
PACS1-201ENST00000320580 MYT1Q01538 1121 aa26.79■■□□□ 1.88
PACS1-201ENST00000320580 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.66■■□□□ 1.86
PACS1-201ENST00000320580 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PACS1-201ENST00000320580 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PACS1-201ENST00000320580 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PACS1-201ENST00000320580 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.85■■□□□ 1.73
PACS1-201ENST00000320580 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PACS1-201ENST00000320580 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.6■■□□□ 1.69
PACS1-201ENST00000320580 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PACS1-201ENST00000320580 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PACS1-201ENST00000320580 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.68
PACS1-201ENST00000320580 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.5■■□□□ 1.67
PACS1-201ENST00000320580 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.49■■□□□ 1.67
PACS1-201ENST00000320580 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PACS1-201ENST00000320580 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PACS1-201ENST00000320580 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PACS1-201ENST00000320580 ABCC9O60706 1549 aa25.23■■□□□ 1.63
PACS1-201ENST00000320580 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PACS1-201ENST00000320580 NEUROD1Q13562 356 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS1-201ENST00000320580 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.02■■□□□ 1.6
PACS1-201ENST00000320580 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PACS1-201ENST00000320580 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.94■■□□□ 1.58
PACS1-201ENST00000320580 TRIM41Q8WV44 630 aa24.93■■□□□ 1.58
PACS1-201ENST00000320580 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PACS1-201ENST00000320580 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS1-201ENST00000320580 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.69■■□□□ 1.54
PACS1-201ENST00000320580 NEFLP07196 543 aa24.54■■□□□ 1.52
PACS1-201ENST00000320580 APLP2Q06481 763 aa24.42■■□□□ 1.5
PACS1-201ENST00000320580 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
PACS1-201ENST00000320580 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PACS1-201ENST00000320580 BCL11AQ9H165 835 aa24.35■■□□□ 1.49
PACS1-201ENST00000320580 BCANQ96GW7 911 aa24.33■■□□□ 1.49
PACS1-201ENST00000320580 SCRIBQ14160 1630 aa24.21■■□□□ 1.47
PACS1-201ENST00000320580 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.21■■□□□ 1.47
PACS1-201ENST00000320580 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PACS1-201ENST00000320580 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PACS1-201ENST00000320580 MIER1Q8N108 512 aa24.05■■□□□ 1.44
PACS1-201ENST00000320580 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PACS1-201ENST00000320580 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.92■■□□□ 1.42
PACS1-201ENST00000320580 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.81■■□□□ 1.4
PACS1-201ENST00000320580 NACADO15069 1562 aa23.8■■□□□ 1.4
PACS1-201ENST00000320580 FKBP8Q14318 412 aa23.8■■□□□ 1.4
PACS1-201ENST00000320580 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.79■■□□□ 1.4
PACS1-201ENST00000320580 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PACS1-201ENST00000320580 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PACS1-201ENST00000320580 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PACS1-201ENST00000320580 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.58■■□□□ 1.37
PACS1-201ENST00000320580 ITGAEP38570 1179 aa23.56■■□□□ 1.36
PACS1-201ENST00000320580 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.47■■□□□ 1.35
PACS1-201ENST00000320580 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.43■■□□□ 1.34
PACS1-201ENST00000320580 NBR1Q14596 966 aa23.43■■□□□ 1.34
PACS1-201ENST00000320580 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PACS1-201ENST00000320580 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PACS1-201ENST00000320580 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PACS1-201ENST00000320580 ANP32CO43423 234 aa23.31■■□□□ 1.32
PACS1-201ENST00000320580 TRIM52Q96A61 297 aa23.3■■□□□ 1.32
PACS1-201ENST00000320580 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PACS1-201ENST00000320580 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PACS1-201ENST00000320580 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PACS1-201ENST00000320580 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PACS1-201ENST00000320580 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PACS1-201ENST00000320580 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PACS1-201ENST00000320580 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PACS1-201ENST00000320580 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
PACS1-201ENST00000320580 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PACS1-201ENST00000320580 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.11■■□□□ 1.29
PACS1-201ENST00000320580 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
PACS1-201ENST00000320580 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PACS1-201ENST00000320580 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PACS1-201ENST00000320580 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.94■■□□□ 1.26
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PACS1-201ENST00000320580 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.87■■□□□ 1.25
PACS1-201ENST00000320580 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PACS1-201ENST00000320580 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PACS1-201ENST00000320580 WIZO95785 1651 aa22.84■■□□□ 1.25
PACS1-201ENST00000320580 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PACS1-201ENST00000320580 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PACS1-201ENST00000320580 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.8■■□□□ 1.24
PACS1-201ENST00000320580 CEP162Q5TB80 1403 aa22.79■■□□□ 1.24
PACS1-201ENST00000320580 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PACS1-201ENST00000320580 KCNH8Q96L42 1107 aa22.75■■□□□ 1.23
PACS1-201ENST00000320580 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.71■■□□□ 1.23
PACS1-201ENST00000320580 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.65■■□□□ 1.22
PACS1-201ENST00000320580 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.65■■□□□ 1.22
PACS1-201ENST00000320580 SMARCA4P51532 1647 aa22.63■■□□□ 1.21
PACS1-201ENST00000320580 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.62■■□□□ 1.21
PACS1-201ENST00000320580 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.62■■□□□ 1.21
PACS1-201ENST00000320580 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PACS1-201ENST00000320580 NEFMP07197 916 aa22.61■■□□□ 1.21
PACS1-201ENST00000320580 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.59■■□□□ 1.21
PACS1-201ENST00000320580 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.53■■□□□ 1.2
PACS1-201ENST00000320580 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PACS1-201ENST00000320580 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.52■■□□□ 1.2
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