Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTD1Q8N815 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms