Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms